小鼠主動脈內皮細胞分離自主動脈組織；主動脈是體循環的動脈主干。其運行路徑為：升主動脈起于左心室，至右側第2胸肋關節高度移行為主動脈弓，弓行向左后至第4胸椎體下緣移行為降主動脈；在第12胸椎體高度穿膈的主動脈裂孔移行為腹主動脈，以上為胸主動脈，至第4腰椎體下緣分為左、右髂總動脈；髂總動脈在骶髂關節高度分為髂內、外動脈。主動脈內皮細胞是覆蓋在主動脈內面的單層細胞，可分泌一系列血管活性物質而保持血管穩態，當其受到炎癥或其它因素刺激后穩態被破壞而導致一些心血管疾病的發生。因此，主動脈內皮細胞已成為研究心血管疾病發病機制及治療藥物的工具。內皮細胞或血管內皮是一薄層的專門上皮細胞，由一層扁平細胞所組成。它形成血管的內壁，是血管管腔內血液及其他血管壁（單層鱗狀上皮）的接口。內皮細胞是沿著整個循環系統，由心臟直至最小的微血管。主動脈內皮細胞（aortic endothelial cells）組成了主動脈內壁，并持續受到血流剪切應力的影響。內皮細胞在切應力的作用下，分泌不同的內皮因子并進而影響血管收縮和生長。主動脈內皮細胞也調節細胞黏附分子的表達來控制和精確調節炎癥反應和組織纖維化。體外培養的原代主動脈內皮細胞可有效地幫助研究者研究內皮功能失調的機理，動脈粥樣化等疾病的發病機理以及發展新的治療方法。